В тысячелетие 33 по Имперскому Летоисчислению начались события, которые привели к тому, что в последствии было названо Эрой Отступничества. Издревле между Экклезиархией, Церковью Бога-Императора и Министорумом, корпусом Имперских чиновников, которые занимались текущими делами Империума, шла борьба за окончательную власть над Империумом. Церковные чины считали, что их принадлежность к духовенству дает им прямое знание воли Императора, и предоставляет им право править Империумом по своему усмотрению. В Министоруме же считали, что в Империуме следует сохранять баланс власти, не концентрируя ее в одних руках, и полагались на орган коллективного управления, Совет Верховных Лордов Терры, в который входили представители всех сил Империума, включая Адептус Механикус и Космический Десант. Опираясь на свои убеждения, клерки Министорума противостояли требованиям Экклезиархии. С переменным успехом подковерная борьба за власть в Совете продолжалась два тысячелетия, пока Экклезиархия постепенно не потеряла большую своей политической власти, ослабленная в борьбе с Министорумом.

Стремясь ослабить влияние Министорума на дела Церкви, Экклезиарх Бенедикт IV решил перенести Священный Синод на другую планету, подальше от Терры. Несмотря на сопротивление наиболее фанатичных кардиналов, которые считали что центр Церкви Бога-Императора должен располагаться рядом с бессмертным телом живого бога, Священный Синод был перенесен на Офелию VII. Там процесс пошел в обратную сторону. За полтысячелетия отдаления от центра власти Империума, Экклезиархия не только восстановила свое влияние, но и приобрела еще больший авторитет. Несмотря на то, что отдельные Экклезиархи пытались вернуть церковь от политики к делам веры, Церковь становилась все более и более коррумпированной и разлагалась, превращаясь в чудовищного спрута, который опутывал Империум своими щупальцами. И когда пришло время великих испытаний для Империума, Церковь не смогла справиться с искушениями и соблазнами.

Для Империума настали темные времена. Катастрофически увеличилось количество варп-штормов, которые настолько затруднили космоплавание, что целые сектора оказались отрезаны от Империума. Расколотый на части Империум не смог сдержать внешних и внутренних врагов и повсюду воцарился хаос. Многие планеты Империума откололись от него, и многочисленные тираны провозгласили себя богами. Демоны шагали по многим планетам, а чужаки, орки, эльдар и многие другие кинулись на ослабшее тело гиганта, разрывая его на куски.

Но вершиной Эры Раздора стало воцарение Экклезиарха Вандира. На волне апокалипсических настроений жителей Империума, он взошел на трон Церкви Бога-Императора и железной рукой подмял под себя Совет Верховных Лордов Терры. Никто не мог ему противоречить, так началось его Кровавое Правление. Только космические десантники и правители Марса, последователи Бога-Машины, не попали под его власть и покинули Совет.

Власть Вандира длилась почти 50 лет. За это время он совершил множество паломничеств по всему Империуму, проповедуя свое видение слова Императора, и вместе со многими паломниками за ним шли бессчетные Легионы Братства Храмовников, войск Экклезиархии, которые огнем и мечом помогали Вандиру вбивать в головы Имперских граждан свои догмы. Многие кардиналы также взрастили огромные армии, которые использовали для того, чтобы насаждать свою власть над планетами и карать тех, кого считали еретиками. Но еретиком, в глазах жадных до золота служителей церкви, мог стать каждый, и никакой суд не мог оправдать того, на кого указывал обвиняющий перст церкви. В одном из своих походов Вандир обнаружил секту Дочерей Императора, женский монашеский Орден, посвятивший себя служению Императору с оружием в руках. Он взял их в свой дворец на Терру и сделал их своими наперсницами и охранниками. Уверенные в том, что они служат святому, ведомому волей Императора, Дочери служили ему верой и правдой.

Но Кровавое Правление не могло продолжатся вечно. Ведомые самыми верными слугами Императора, его сынами, космическими десантниками, по всей галактике начались выступления против безумного Экклезиарха. Средоточием духовного возрождения Империума стал святой Себастиан Тор. Простой проповедник, он был осенен видением Императора, который призвал его на свою святою службу. За три дня он очистил свою планету от коррумпированных служителей церкви, зажигая своими речами, огонь чистой веры в сердцах всех, кто его слушал, и повел свое святое воинство по галактике, очищая Империум от скверны. Вместе с ним в поход выступили Адептус Астартес, а также последователи Бога-Машины, Адептус Механикус. Война была долгой и трудной, тем более что кроме слуг Вандира, Тору приходилось сражаться с наполнившими планеты Империума демонами и чужаками. Но воля Императора была на его стороне. Там где на путях вандировых клевретов бушевали жестокие варп-штормы, на пути Тора простиралась тишь да гладь, и самые жестокие и могучие демонические охотники варпа бежали в ужасе от его святого сияния. Дойдя до Терры, войска Тора осадили дворец Вандира, но взять его не смогли.

Дочери Императора фанатично сражались с теми, кого они считали захватчиками и еретиками, покушающимися на святого человека. Ситуация зашла в тупик, и Терре грозили огромные разрушения в длительной осаде. Но тогда в битву вмешался сам Император. Капитан Адептус Кустодес, тех, кто следил за работой Золотого Трона Императора, тех, которые были самыми доверенными его слугами, пришел однажды ночью к старшей среди Дочерей и призвал ее предстать перед ликом самого Императора. Никто не знает, что произошло между богом и самой его фанатичной последовательницей, но утром Вандир был мертв, а Дочери Императора сдались на милость Тора. Кровавое Правление Вандира, а вместе с ним и Эра Отступничества закончилась. Совет Верховных Лордов Терры был восстановлен и первый же эдикт, который он принял, запрещал иметь Экклезиархии вооруженные силы. Единственным боевым подразделением Церкви остались Дочери Императора.

С того момента Экклезиархия обрела свое боевое крыло, Адепта Сороритас. Сестры Битвы, как еще называют Адепта Сороритас, подразделяются на Ордены. По слову и приказу Экклезиарха сестрами управляет Аббатиса. Она не принадлежит ни к одному Ордену, и выбирается конвентом Канонисс, глав Орденов. Аббатиса обладает большой властью в Священном Синоде, высшем органе церкви. Чуть ниже Аббатисы в иерархии сестер стоят Канониссы, главы Орденов. В самом начале, тогда когда на престол Экклезиарха взошел Святой Тор, победитель Вандира, и сразу после того как Дочери Императора стали Сестрами Битвы было основано два Женских монастыря, по одному на каждую главную планету Экклезиархии, Землю и Офелию VII. Изначально сестер было не многим более четырех тысяч. Позднее, уже после смерти Тора, когда численность сестер достигла десяти тысяч, Женские монастыри были преобразованы и разбиты на четыре Ордена: Эбонитовой Чаши, Благородного Сердца, Серебряного Покрова и Горячего Сердца. Позднее, спустя две с половиной тысячи лет были основаны еще два Ордена - Кровавой Розы и Священной Розы. Количество Орденов остается неизменным по сей день. Тем не менее, внутри старших Орденов существуют младшие Ордены, имеющие свои геральдические цвета и боевые традиции. Самым известным среди них является Орден Пресвятой Девы-Мученицы.

Внутри Орденов поддерживается строгая иерархия. Канонисса и ее сестры игуменьи тренируют сестер в путях войны. Основным источником пополнения Адепта Сороритас является Школа Прогениум, приют для сирот служителей Империума, которые погибли на Имперской службе. Тогда как большинство мальчиков из Школы становятся Имперскими комиссарами, девочкам открыт путь в Адепта Сороритас.

В отличие от обычных войск, таких как Имперская Гвардия, Сестры Битвы не часто принимают участие в полномасштабных боевых действиях. Главной задачей сестер является посильная помощь святой Церкви Бога-Императора в распространении святого света веры по галактике. Они несут службу на дальних форпостах Империума, где располагаются миссии Экклезиархии. Также на плечи сестер ложится священный долг по защите Церковных Миров Империума. Церковные Миры подобны священным реликвиям. Вся планета посвящается служению Императору, и многие миллионы верующих молятся непрерывно в храмах такого мира, укрепляя своей верой Бессмертного Императора. Нет более желанной цели для последователей Хаоса, чем разорение Церковного Мира. Но сестры Битвы несут вечную стражу на таких планетах и неустанно отражают нападения последователей Разрушительных Сил, храня верность Императору.